I Discepoli di Padre Pio organizzano, nel corso dell'anno, numerosi pellegrinaggi in Italia e nel mondo.
Tra le principali mete spirituali:
- San Giovanni Rotondo
- Pietralcina
- Lanciano
- Manoppello
- Monte Sant'Angelo
- Santuario dell'Incoronata a Foggia
- Medjugorie